Le contrôle de l'intégrité des fichiers dans EzGED est rendu possible par le calcul d'une empreinte du fichier au moment de son stockage. On utilise l'algorithme RIPEMD-160 pour calculer cette empreinte.

Le calcul de l'empreinte du fichier au moment de son stockage est systématique. Par contre si l'utilisateur souhaite être informé visuellement dans l'interface qu'un fichier a été altéré, il doit explicitement activer le contrôle de l'intégrité des documents via son profil.